Το νησί δεν παρουσιάζει έντονες κλίσεις εδάφους και προσφέρεται για πεζοπορία.
Η ψηλότερη κορυφή είναι ο Μύλος (133 μ.).
Η ακτογραμμή του, εν τούτοις, είναι έντονα δαντελωτή, με πολλούς όρμους, βραχώδεις και αμμώδεις, και με περίπου 15 ήσυχες παραλίες που προσφέρονται για κολύμπι: Φύκιο, Αλμυρός, Λιόλιου, Φουντάνα, Γερολιμνιώνας, Λιβάδι, Αλιγαριά, Ψιλή Άμμος, Τσιγκούρι κ.ά.
Το ημίξηρο κλίμα της Σχοινούσας παρουσιάζει σχετικά μικρό εύρος θερμομετρικών αυξομειώσεων, με ήπιο χειμώνα (8-12°C) και παρατεταμένο καλοκαίρι.
Το ετήσιο ύψος της βροχόπτωσης είναι περιορισμένο και για τον λόγο αυτό το νησί αντιμετωπίζει δυσκολίες στην ύδρευση. Το πόσιμο νερό εισάγεται με υδροφόρο πλοίο.
